為增進旅遊環境品質，澎管處「小門地質探索館」自明(112)年1月1日起開始收費-澎湖國家風景區管理處行政資訊網

小門地質探索館由國際知名藝術大師-葛萊美獎評審蕭青陽老師進行創意發想，以博物館新視野的概念及導向，營造今昔之時空交織、穿梭奇幻旅途的體驗場所，加上自然景致、海洋生活文化與地景藝術的融入等，期創造躍進式觀光想像，充實小門嶼觀光遊憩內涵與深度，已成為澎湖重要的旅遊景點之一。
小門地質探索館過去開放參觀並未收取門票，澎管處為因應政府政策，並能有效且落實執行本館之管理維護工作及推展人文教育之需要，且基於使用者付費之原則，訂定收費標準，並自112年1月1日起開始收費。
收費票價分為三類，全票為新臺幣30元整、優待票為新臺幣15元整及免收門票。
優待票適用標準為年滿65歲以上者於假日參觀者、學生、持志願服務榮譽卡之義勇警察、義勇消防及十人以上之團體；免收門票適用標準為未滿六歲兒童、年滿六十五歲以上者於平日參觀者、持志願服務榮譽卡志工及身心障礙者及其必要陪伴者一人。